由于史料沒有任何明文記載，沈陽故宮究竟何年開始建造，一直是歷史上的一大懸案，也是歷史學家們爭論的一個焦點。

　　沈陽故宮博物院研究室主任佟悅說，這可能是因為修建皇宮是件勞民傷財?shù)呐e動，清代統(tǒng)治者認為不值得提倡，而且修建宮殿本身也就是為皇帝建個家，沒必要將具體建造年份寫進史書。然而幾年前，鞍山市文物站的一位工作人員在當?shù)匕l(fā)現(xiàn)了一本《侯氏宗譜》，其中關(guān)于修建遼陽東京城和沈陽盛京城的記載非常詳細。

　　據(jù)《侯氏宗譜》記載，負責為沈陽故宮燒制琉璃瓦的侯振舉家族是“于天命九年間遷至沈陽，復創(chuàng)作宮殿龍樓鳳闕以及三陵各工等用”。有專家據(jù)此推斷，沈陽故宮應(yīng)該是在天命九年，也就是1624年開始建造的。

　　2003年1月15日，沈陽晚報發(fā)表了一篇題為《沈陽故宮到底建在哪一年？》的文章，經(jīng)沈陽故宮博物院院長、清前史專家支運亭研究員多年研究，認定沈陽故宮的始建年代應(yīng)為1624年（天命九年）。

　　但佟主任卻不贊同這一說法，他認為，《侯氏宗譜》中所說的“天命九年”指的是侯振舉一家遷居沈陽的時間，而不是說侯振舉搬到沈陽后就立即開始建造故宮。佟悅認為，沈陽故宮應(yīng)該是從1625年開始建造的，理由有二：首先，1624年，東京城還沒有建好，許多貝勒、大臣都還在忙著建自己的住所，努爾哈赤在沒有下達遷都命令之前，不可能在沈陽建造故宮；其次，努爾哈赤居住在位于城北的罕王宮，而不是故宮里。如果沈陽故宮1624年就開始修建的話，那么努爾哈赤為什么不住在故宮里反而要在故宮城旁居�。�