車主不知情車牌被遮擋不一定會扣12分，需視具體情況而定。

在交通法規(guī)中，故意遮擋車牌會面臨罰款200元、記12分的處罰，但“故意”的界定相對模糊。如果車主能證明確實不知情，存在特殊合理原因，如因他人惡意遮擋、車輛自身濺起泥水等情況，通常有不同的處理方式。若因他人故意遮擋車牌，駕駛員說明情況并積極配合調查，一般不會被認定為故意遮擋車牌，也就不會受處罰；若是車輛自身濺起泥水未及時清理導致車牌被遮擋，被交警發(fā)現(xiàn)可能會被認定為未保持車牌清晰完整，可處警告或者二十元以上二百元以下罰款。

若被電子眼抓拍，車主需提供能證明不知情的合理證據(jù)，經(jīng)核實屬實后可能從輕處罰，否則按規(guī)定罰款、扣分。而如果被交警當場查獲，即便不知情，也可能面臨罰款20元以上200元以下和記12分的處罰。不過，要是發(fā)現(xiàn)及時并主動糾正，移除遮擋物恢復原狀，交警可能僅給予口頭警告，不進行實質性處罰。

車主不知情時車牌被遮擋的處罰情況較為復雜，受到多種因素影響。為避免不必要的麻煩，車主日常駕車時應養(yǎng)成開車前檢查車輛狀況，特別是查看車牌是否清晰的習慣。