科目二棄考是要付費的，因為錯過考試相當于考了一次沒通過，所以需要重新預約考試，并支付補考費用。根據(jù)《機動車駕駛證申領和使用規(guī)定》(公安部令第162號)第四十六條規(guī)定，報考人員因故不能在原定時間參加考試的，應當提前一天申請取消預約。如報考者未按預定考試時間參加考試，則判定考試不合格。 二、補考繳費流程： 1.首先打開手機里的“交管12123”，如下圖所示。 2.然后在打開的軟件主頁面點擊“更多”，如下圖。 3.然后在更多打開的頁面中，找到“駕照業(yè)務”類別，點擊“繳納考試費”。 4.這時候如果辦理了業(yè)務，就可以付款了；如果沒有，就不能付款。