公司車輛登記證書丟失補(bǔ)辦的方法如下：1、公司代理人攜帶所需資料，開車到車輛注冊(cè)地車管所及各服務(wù)站辦理；2、車輛通過(guò)專門的查驗(yàn)通道，直接到查驗(yàn)點(diǎn)，開始查驗(yàn)車輛；3、車管所工作人員對(duì)車輛進(jìn)行查驗(yàn)，查驗(yàn)完成后，車主到查驗(yàn)服務(wù)處確認(rèn)信息；4、接著車主到業(yè)務(wù)大廳導(dǎo)辦服務(wù)臺(tái)辦理手續(xù)，排隊(duì)等待辦理；5、辦理手續(xù)后，在等候區(qū)等待叫號(hào)辦理業(yè)務(wù)，然后到對(duì)應(yīng)窗口進(jìn)行辦理；6、攜帶受理憑證到收費(fèi)窗口交費(fèi)；7、車主到取證窗口打印機(jī)動(dòng)車登記證書，補(bǔ)辦完成。