牧馬人改裝后的年檢流程如下：

1、首先，要確保改裝車符合相關法規(guī)和標準，否則在路遇交警查處時可能會受到處罰。

2、其次，必須前往車管所進行備案登記，并獲取機動車年審證。只有通過車管所的驗車程序，確保車輛安全合格，才能正常上路行駛。

3、需要注意的是，未經交警部門批準的私自改裝是違法行為。涉及到車輛安全數(shù)據(jù)的改裝必須要獲得相關部門的許可。

總之，為了避免不必要的麻煩和處罰，建議牧馬人車主在改裝前咨詢相關法規(guī)，并確保改裝符合規(guī)定，及時辦理備案登記和年審手續(xù)。