駕駛C1駕駛證駕駛摩托車(chē)被扣12分的處理辦法如下：

首先，需要參加為期七日的道路交通安全法律、法規(guī)和相關(guān)知識(shí)學(xué)習(xí)。在十五日內(nèi)，機(jī)動(dòng)車(chē)駕駛證核發(fā)地或者違法行為地公安機(jī)關(guān)交通管理部門(mén)將組織學(xué)習(xí)。

學(xué)習(xí)結(jié)束后，車(chē)輛管理所將在二十日內(nèi)對(duì)駕駛?cè)诉M(jìn)行道路交通安全法律、法規(guī)和相關(guān)知識(shí)考試。

如果考試合格，記分將被清除，機(jī)動(dòng)車(chē)駕駛證將被發(fā)還；如果考試不合格，駕駛?cè)藢⒗^續(xù)參加學(xué)習(xí)和考試。如果駕駛?cè)司懿粎⒓訉W(xué)習(xí)，也不接受考試，公安機(jī)關(guān)交通管理部門(mén)將公告其機(jī)動(dòng)車(chē)駕駛證停止使用。

值得注意的是，駕駛C1駕駛證行駛摩托車(chē)是準(zhǔn)駕車(chē)款不符，屬于無(wú)證駕駛。如果被交警查出，將會(huì)被記9分，并處以200元以上兩千元以下的罰款。

根據(jù)《道路交通安全違法行為記分管理辦法》第九條第五項(xiàng)，駕駛與準(zhǔn)駕車(chē)型不符的機(jī)動(dòng)車(chē)的機(jī)動(dòng)車(chē)駕駛?cè)艘淮斡?分。

同時(shí)，根據(jù)《中華人民共和國(guó)道路交通安全法》第九十九條第一項(xiàng)，未取得機(jī)動(dòng)車(chē)駕駛證、機(jī)動(dòng)車(chē)駕駛證被吊銷(xiāo)或者機(jī)動(dòng)車(chē)駕駛證被暫扣期間駕駛機(jī)動(dòng)車(chē)的，由公安機(jī)關(guān)交通管理部門(mén)處以二百元以上二千元以下的罰款。