手動變速箱維修費用通常比自動變速箱低不少。

一般來說，4S 店維修手動擋變速箱價格約 1000 元，自動擋約 700 元。手動擋維修費用通常不超 2000 元，而自動擋從一兩千元到上萬元不等。

比如 4 速自動變速箱維修可能需 2000 元，6 速自動可能要 3000 元。手動變速箱修理費用一般在幾百元到數千元之間。

維修費用差異主要受這些因素影響：配件通用程度，冷門車型配件少，部分需國外訂購，成本增加；修理廠技術水平不同，價格有別；維修復雜程度，復雜的維修需要專業(yè)技術和設備，價格更高。

手動變速箱常見維修項目如更換同步器和倒擋齒輪，成本相對低。常見故障像漏油、濾油器堵塞等，修理費通常不超 2000 元。面包車手動變速箱維修約三百元，中檔次轎車上千。

干式雙離合器維修約 6000 元，無級變速器約 5000 元，自動變速器約 3500 元，手動變速器便宜約 1000 元。

半自動變速箱因額外電機成本比手動高 2000 元左右。

像變速箱油泄漏，檢查更換密封圈或線束約 1000 - 3000 元。離合器片磨損更換約 2000 - 4000 元。齒輪損壞更換組件約 5000 - 10000 元。換擋電磁閥故障更換約 2000 - 4000 元。液力變矩器故障更換約 5000 - 10000 元。