一般情況下，因執(zhí)法等合法原因被扣押的摩托車，停車費不應(yīng)由當(dāng)事人承擔(dān)，費用應(yīng)由執(zhí)法部門負責(zé)。按照規(guī)定，交警扣車調(diào)查等期間的停車保管費，本就該由作出扣留決定的行政機關(guān)承擔(dān)。這是為了防止相關(guān)部門謀取不當(dāng)利益，保障當(dāng)事人合法權(quán)益。不過，若車主自愿要求額外服務(wù)產(chǎn)生合理費用，且有明確約定告知，則需車主承擔(dān)。

比如，車主在車輛被扣期間，主動提出要將摩托車存放在特定的高端保管場地，超出了執(zhí)法部門常規(guī)提供的保管范疇，由此產(chǎn)生的額外費用就需要車主自行支付。并且，這種額外服務(wù)及費用必須有清晰明確的約定，并提前告知車主，確保車主知曉并同意。

如果在摩托車被扣后，遇到執(zhí)法部門違規(guī)收取停車費的情況，車主有權(quán)拒絕支付，并向上級部門反映以維護自身合法權(quán)益。車主可以通過正規(guī)的投訴渠道，如向相關(guān)執(zhí)法部門的上級主管單位、紀檢監(jiān)察部門等進行舉報，提供詳細的違規(guī)收費證據(jù)，讓違規(guī)行為得到糾正。

另外，因交通事故扣押摩托車時，停車費通常也不由車主承擔(dān)。相關(guān)法規(guī)明確規(guī)定，不得扣留事故車輛所載貨物等，停車費由作出扣押決定的交管部門承擔(dān)。但要是車主逾期未領(lǐng)取摩托車，依據(jù)法律法規(guī)，此后產(chǎn)生的停車費就需自行承擔(dān)。

總之，摩托車扣車后的停車費承擔(dān)問題，在遵循法律規(guī)定的基礎(chǔ)上，要依據(jù)具體情形來判斷。車主應(yīng)了解自身的合法權(quán)益，遇到不合理收費堅決維護自身利益，同時，在處理扣車事宜時要及時、依規(guī)，避免因自身原因產(chǎn)生不必要的停車費用。