一般來說，4S店代辦車輛過戶費用會比普通代辦機構高。普通代辦機構的基礎代辦服務費多在200 - 800元，而4S店通常收取500 - 1500元。這是因為4S店可能因提供一站式服務產(chǎn)生額外服務費用，且不同4S店定價差異較大。不過，車輛過戶費用受多種因素影響，如地區(qū)、車輛類型、手續(xù)情況等，所以實際費用也會有所不同 。

從地區(qū)因素來看，不同地方經(jīng)濟發(fā)展水平和市場行情差異顯著。在一線城市，由于整體消費較高、市場競爭格局不同，無論是4S店還是普通代辦機構，收費普遍比二三線城市高。但即便如此，4S店的收費依然會高于普通代辦機構。比如在上海，普通代辦機構可能收取600 - 800元，而4S店則可能達到1000 - 1500元。

車輛類型也會對過戶費用產(chǎn)生影響。普通家用轎車過戶相對簡單，費用相對較低。小型汽車過戶費一般在300元到500元上下。而豪華型車輛由于本身價值高，涉及的交易稅等費用更高，過戶總費用可能達數(shù)千元。在這種情況下，4S店和普通代辦機構都會因車輛價值高、手續(xù)復雜而提高收費，但4S店的加價幅度往往更大。

另外，車輛手續(xù)情況也很關鍵。如果車輛手續(xù)齊全，代辦難度低，費用自然低。可要是手續(xù)缺失、處于查封或抵押狀態(tài)等，代辦難度增加，費用就會大幅提高。普通代辦機構可能會將費用提高到400至800元甚至更高，4S店同樣會提高收費，且通常比普通代辦機構要高。

總之，雖然不能絕對地說4S店代辦車輛過戶費用一定比普通代辦機構高很多，但在大多數(shù)情況下，由于4S店的服務模式及運營成本等因素，其收費確實會高于普通代辦機構。在選擇代辦機構時，車主不僅要考慮費用，還要綜合考量服務質量、機構信譽等多方面因素 。