手動變速箱和自動變速箱的價格差異因多種因素而異，一般差價少則幾千元，多則數萬元。手動變速箱構造相對簡單，價格通常在 3000 元至 10 萬元之間；自動變速箱構造復雜，價格多處于 5000 元到 20 萬元的區(qū)間。不同品牌、車型以及自動變速箱的類型都會使價格有所不同，例如愛信 6AT 與采埃孚 9AT 價格相差較大，購車或維修時需綜合多方面因素考量。

在普通家用轎車領域，價格差異較為明顯。新車價格在七八萬元左右的車型，手動變速箱更換價格大致在3000元到4000元，而自動變速箱至少需要1萬元左右。這其中，不同類型的自動變速箱價格也有差異。像日系CVT無級變速箱，質量較好的大約1萬元，普通的約5000元；大眾濕式雙離合變速箱約8000元到1.5萬元，干式雙離合變速箱約6000元到8000元。

如果是豪華跑車或大型卡車，差距就更為懸殊。普通家用轎車的自動變速器可能500到1500美元（折合人民幣3500到10500元），而豪華跑車或大型卡車的自動變速器可能好幾萬美元，折合人民幣一二十萬甚至更多。例如采埃孚9AT約5萬元，8AT約3到4萬元。

另外，更換變速箱的場所不同，費用也有差別。4S店更換變速箱，通常會收取約1000元的費用，而普通修理店則相對便宜，大約200元。

總之，手動變速箱與自動變速箱的價格差波動范圍較大。無論是購車時考慮不同配置車型，還是車輛后期需要更換變速箱，都要充分了解具體車型對應的變速箱價格情況，結合自身的經濟實力、使用需求等因素，做出最合適的選擇 。