摩托車駕駛證和汽車駕駛證不合并不會直接影響各自審證，但存在諸多不便。按照規(guī)定，每人只能有一個駕駛證，二者最好進行合并。若不合并，需分別攜帶，可能因拿錯證面臨處罰，且要分別進行有效期更換。合并后，一本證就能駕駛汽車和摩托車，年審只需一年一次，不僅方便車主，也利于交警管理，讓駕駛行為更規(guī)范安全 。

從實際管理角度來看，二者不合并還可能在處理交通違章等情況時帶來麻煩。盡管它們獨立申領，但在實際的交通管理系統(tǒng)中，二者的信息是關聯(lián)的。一旦有違章行為，即使駕駛證沒有合并，違章扣分等記錄依然會如實記錄在對應的證件上。若一本駕照有違章未處理，在審證時，系統(tǒng)會有所提示，雖然不會直接導致另一本駕照審證不通過，但可能會增加不必要的時間和精力消耗，車主需要分別到不同窗口或者通過不同流程去處理違章和審證事宜。

而且，若發(fā)生酒駕、毒駕等嚴重違法行為，無論駕駛的是汽車還是摩托車，即使兩個駕駛證沒有合并，兩個準駕資格都會被注銷。這充分說明，雖然表面上看二者不合并不影響審證，但在涉及嚴重違法問題時，它們是一體的。

另外，從保險理賠方面考慮，若駕駛未按規(guī)定年檢或年檢不合格的摩托車發(fā)生事故，即便汽車駕駛證沒有問題，也會因摩托車相關問題導致無法獲得保險理賠。

綜上所述，雖然摩托車駕駛證和汽車駕駛證不合并不會直接影響審證流程，但合并能在多方面帶來便利，無論是證件攜帶、審證流程，還是應對可能出現(xiàn)的違章、事故等情況，都更加合理高效，所以建議將二者進行合并 。