三輪摩托車駕駛證扣分后，處理方式如下：

首先，根據不同的違章情形會有不同處理。比如超速行駛、闖紅燈、酒后駕駛等危險行為被查處，一般會罰款、扣分，嚴重的會吊銷駕駛證。若只是輕微越線停車，按扣點分處理。

其次，被扣分后要在規(guī)定時間內參加道路交通安全法規(guī)和安全知識的學習和測試，有條件可參加駕駛員安全文明教育，同時按時繳納罰款。

還可以通過交管 12123 上的“學法減分”功能學習，按規(guī)定通過網上或現場學習并考試，以及參加公益活動減免記分分值。

要注意，三輪摩托車駕駛扣分處理是根據道路交通安全法規(guī)定進行的，違反交通法規(guī)會扣除不同的分值和罰款。

駕駛三輪摩托車一定要嚴格遵守交通規(guī)則，注意交通安全，避免扣分。